Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK1Q9NYA1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK1Q9NYA1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK1Q9NYA1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPHK1Q9NYA1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK1Q9NYA1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK1Q9NYA1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHK1Q9NYA1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHK1Q9NYA1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.1 ms