Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX2Q9NPC8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX2Q9NPC8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms