Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SARS2Q9NP81 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SARS2Q9NP81 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms