Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC40A1Q9NP59 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms