Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GFRA4Q9GZZ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms