Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHCBP1LQ9BZQ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms