Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GINS3Q9BRX5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.7 ms