Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL3

ZNF599, Zinc finger protein 599, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF599Q96NL3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF599Q96NL3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF599Q96NL3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms