Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP9Q8IXQ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms