Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGDCC3Q8IVU1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms