Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST9Q7L1S5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms