Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1Q6P1K2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PMF1Q6P1K2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 778.8 ms