Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SWSAP1Q6NVH7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SWSAP1Q6NVH7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms