Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARD17Q5XLA6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD17Q5XLA6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms