Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC181Q5TID7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC181Q5TID7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC181Q5TID7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms