Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTUD3Q5T2D3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms