Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms