Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms