Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF5Q13243 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF5Q13243 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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