Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX2Q02962 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms