Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCEQ02156 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCEQ02156 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCEQ02156 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms