Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRP54P61011 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRP54P61011 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP54P61011 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP54P61011 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP54P61011 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP54P61011 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP54P61011 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP54P61011 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP54P61011 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP54P61011 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP54P61011 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP54P61011 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP54P61011 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRP54P61011 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP54P61011 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP54P61011 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP54P61011 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP54P61011 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP54P61011 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP54P61011 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP54P61011 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP54P61011 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP54P61011 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP54P61011 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP54P61011 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP54P61011 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP54P61011 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP54P61011 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP54P61011 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SRP54P61011 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP54P61011 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms