Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM4SF4P48230 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TM4SF4P48230 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF4P48230 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms