Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP13P45452 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP13P45452 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP13P45452 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP13P45452 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP13P45452 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP13P45452 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP13P45452 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP13P45452 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP13P45452 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP13P45452 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP13P45452 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP13P45452 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP13P45452 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP13P45452 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP13P45452 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP13P45452 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP13P45452 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP13P45452 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP13P45452 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP13P45452 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP13P45452 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP13P45452 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP13P45452 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP13P45452 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP13P45452 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP13P45452 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP13P45452 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP13P45452 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP13P45452 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP13P45452 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP13P45452 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP13P45452 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP13P45452 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP13P45452 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP13P45452 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP13P45452 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP13P45452 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP13P45452 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP13P45452 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP13P45452 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP13P45452 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP13P45452 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP13P45452 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP13P45452 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP13P45452 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP13P45452 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP13P45452 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP13P45452 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP13P45452 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP13P45452 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP13P45452 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP13P45452 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP13P45452 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP13P45452 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP13P45452 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP13P45452 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP13P45452 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP13P45452 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP13P45452 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP13P45452 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP13P45452 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP13P45452 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP13P45452 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP13P45452 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP13P45452 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP13P45452 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP13P45452 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP13P45452 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP13P45452 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP13P45452 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP13P45452 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP13P45452 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP13P45452 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP13P45452 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP13P45452 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP13P45452 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP13P45452 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms