Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSOP43234 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSOP43234 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSOP43234 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSOP43234 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSOP43234 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSOP43234 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSOP43234 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSOP43234 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSOP43234 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSOP43234 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSOP43234 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSOP43234 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSOP43234 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSOP43234 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSOP43234 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSOP43234 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSOP43234 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSOP43234 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSOP43234 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSOP43234 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSOP43234 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSOP43234 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSOP43234 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSOP43234 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSOP43234 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSOP43234 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSOP43234 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSOP43234 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSOP43234 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSOP43234 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSOP43234 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSOP43234 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSOP43234 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSOP43234 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSOP43234 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSOP43234 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSOP43234 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSOP43234 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSOP43234 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSOP43234 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSOP43234 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSOP43234 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSOP43234 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSOP43234 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSOP43234 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSOP43234 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSOP43234 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSOP43234 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSOP43234 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSOP43234 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSOP43234 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSOP43234 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSOP43234 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSOP43234 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSOP43234 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSOP43234 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms