Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALRP27797 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CALRP27797 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CALRP27797 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALRP27797 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALRP27797 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALRP27797 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CALRP27797 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALRP27797 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CALRP27797 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CALRP27797 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CALRP27797 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALRP27797 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALRP27797 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALRP27797 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALRP27797 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALRP27797 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALRP27797 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALRP27797 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALRP27797 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALRP27797 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALRP27797 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALRP27797 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALRP27797 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALRP27797 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALRP27797 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALRP27797 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALRP27797 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALRP27797 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALRP27797 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALRP27797 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALRP27797 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALRP27797 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms