Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF28P17035 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF28P17035 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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