Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN7O94888 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBXN7O94888 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms