Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD6O43541 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms