Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KR12 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KR12 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KR12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KR12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3KR12 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KR12 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KR12 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KR12 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KR12 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KR12 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KR12 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KR12 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KR12 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KR12 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3KR12 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KR12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KR12 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KR12 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KR12 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KR12 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KR12 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KR12 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KR12 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KR12 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KR12 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3KR12 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
J3KR12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3KR12 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3KR12 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3KR12 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3KR12 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KR12 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KR12 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KR12 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KR12 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KR12 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KR12 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KR12 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KR12 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KR12 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3KR12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KR12 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KR12 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KR12 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KR12 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KR12 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KR12 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KR12 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3KR12 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KR12 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KR12 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KR12 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KR12 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KR12 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KR12 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KR12 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KR12 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KR12 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KR12 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3KR12 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KR12 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KR12 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KR12 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KR12 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3KR12 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3KR12 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3KR12 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3KR12 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3KR12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3KR12 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3KR12 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3KR12 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3KR12 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3KR12 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
J3KR12 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
J3KR12 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
J3KR12 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
J3KR12 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
J3KR12 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3KR12 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3KR12 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3KR12 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3KR12 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3KR12 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3KR12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3KR12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3KR12 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3KR12 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3KR12 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3KR12 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3KR12 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3KR12 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3KR12 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3KR12 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3KR12 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3KR12 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3KR12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3KR12 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3KR12 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms