Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCRIP1C9JLW8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCRIP1C9JLW8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCRIP1C9JLW8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms