Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM5BQ9UGL1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
KDM5BQ9UGL1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM5BQ9UGL1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms