Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC167Q9P0B6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC167Q9P0B6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC167Q9P0B6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms