Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23BQ9NYZ1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TVP23BQ9NYZ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms