Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD3Q9NX63 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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