Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX01

TXNL4B, Thioredoxin-like protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL4BQ9NX01 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNL4BQ9NX01 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TXNL4BQ9NX01 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TXNL4BQ9NX01 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TXNL4BQ9NX01 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms