Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6CQ9H3T2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6CQ9H3T2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6CQ9H3T2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms