Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHACTR1Q9C0D0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHACTR1Q9C0D0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms