Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF649Q9BS31 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF649Q9BS31 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms