Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS25Q9BRG1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS25Q9BRG1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms