Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP295NLQ96MC4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP295NLQ96MC4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms