Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ZNF479Q96JC4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF479Q96JC4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms