Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF21AQ96BD5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF21AQ96BD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.3 ms