Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A0

KRT222, Keratin-like protein KRT222, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT222Q8N1A0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT222Q8N1A0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT222Q8N1A0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT222Q8N1A0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms