Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED8Q8IZ13 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED8Q8IZ13 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms