Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK4Q6SA08 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK4Q6SA08 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms