Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED27Q6P2C8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED27Q6P2C8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms