Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01545Q5VT33 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms