Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD1BQ3KR37 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD1BQ3KR37 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms