Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN3Q16667 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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